A pergunta mais correta seria "Qual é o valor que posso gerar com um investimento "x"? Esta pergunta é completamente diferente, pois convida nós, consultores, a pensarmos junto com nosso cliente no uso otimizado de recursos versus possibilidades, enquanto a questão 'quanto custa um site?' pressupõe um site pré definido, sem espaço para mudanças na definição.

Um site sempre deve ter um objetivo. O objetivo pode ser de baixo valor, como o de segurar o nome www.minhaempresa.com.br, até um objetivo de alto valor que pode ser por exemplo: ter consumidores que repetidamente adquirem produtos pelo site.

Para um site ter valor para a empresa (ter um retorno do investimento) este site tem que ter um valor para o visitante. O maior problema de criar um site não é o design, ou a programação, o maior problema é fazer um site que tenha um valor para um grupo suficientemente grande de usuários capaz de dar um retorno à empresa.

De forma clara, apenas como exemplo: Você pode investir R$ 100,00 em um website e não ter retorno nenhum. Isso seria um custo. Ou você pode investir R$ 5.000,00 e ter um retorno de R$ 100.000,00. Isso seria um investimento.

Pense bem antes de fazer um site:
Qual é seu público alvo? 
Qual é o retorno esperado?
Que serviços ele presta para seus clientes, colaboradores, fornecedores, etc. ?
Ele aumenta sua receita ?
Ele diminui seus custos operacionais?
Ele melhora seu atendimento?

Defina bem estas questões e você vai pensar melhor em quanto e como investir no seu website.

Uma coisa é certa. No mundo que vivemos quem não está na web não existe!